經過一番休整，林奇和他的新朋友們開始策劃下一步的行動。他們知道，要想徹底摧毀這個組織，必須找到它的總部，揭露其罪行，讓世人知曉。
在老婦人的幫助下，林奇找到了一些關於組織總部的線索。原來，這個組織的總部位於城市的一個廢棄工廠內，平時非常隱蔽，很難被人發現。
為了不打草驚蛇，林奇和他的朋友們決定先偵查一下工廠的情況。他們化身為普通的工人，潛入工廠內部，開始尋找組織的罪證。
在工廠內部，林奇發現了一個驚人的秘密。原來，這個組織不僅控制著城市的經濟活動，還在進行非法的生物實驗。他們將一些無辜的人作為實驗品，研究如何控制人的思想。
林奇憤怒不已，他決定立刻採取行動，解救那些被囚禁的人們。然而，就在他們準備行動的時候，卻被組織的成員發現了。
一場激戰在工廠內部展開。林奇和他的朋友們拼盡全力，終於打敗了敵人，解救了被囚禁的人們。然而，他們也付出了慘痛的代價。其中一位朋友在戰鬥中犧牲了。
面對戰友的犧牲，林奇感到無比悲痛。然而，他知道，不能讓戰友的犧牲白費。他決定繼續前進，將這個組織徹底摧毀。
在工廠的最深處，林奇找到了組織的首領。原來，這個組織的首領竟然是他的親生父親。面對這個殘酷的事實，林奇感到無法接受。然而，他知道，他必須戰勝自己的心魔，才能完成這場戰鬥。
經過一番激戰，林奇終於打敗了他的父親。他將組織的罪行公之於眾，讓世人知曉這個組織的邪惡本質。
在摧毀了組織的總部後，林奇和他的朋友們開始了新的征程。他們知道，雖然組織已經被摧毀，但是還有很多受害者需要他們的幫助。
首先，他們來到了一個名為“希望之家”的地方。這裡收容了許多被組織迫害的人們，包括那些被迫參加非法生物實驗的受害者。林奇和他的朋友們為這些人提供了醫療救助和心理疏導，幫助他們走出陰影，重建新生活。
接下來，林奇和他的朋友們始調查組織的餘黨。他們發現，雖然組織的首領已經被擊敗，但是仍然有一些成員在暗中活動，企圖恢復組織的勢力。為了徹底剷除這些餘黨，林奇和他的朋友們決定深入敵後，展開一場秘密行動。
在一次偶然的機會中，林奇發現了一個關於組織的秘密基地。這個基地位於城市郊區的一個山洞內，是組織成員進行秘密活動的場所。林奇和他的朋友們決定潛入這個基地，尋找更多的線索。
在基地內部，林奇發現了一個令人震驚的事實。原來，組織並沒有完全消失，而是分裂成了兩個派系。一個派系主張繼續進行非法活動，控制城市的經濟和政治；另一個派系則認為組織應該改過自新，迴歸正道。
面對這樣的情況，林奇和他的朋友們決定採取行動。他們先是暗中破壞了支援繼續進行非法活動的那個派系的計劃，然後找到了支援改過自新的那個派系的領導人，勸說他們放棄原來的目標，重新建立一個新的組織，為社會做出貢獻。
經過一番努力，林奇和他的朋友們終於成功地說服了這個派系的領導人。在他們的幫助下，這個派系成功地擺脫了原來那個派系的控制，開始了新的生活。