值得慶幸的是，匠作畠山家的本據七尾城是一座難攻不落的城池，而且城內的守軍也在頑強抗擊加賀一向一揆眾，這就使得畠山駿河守等人無法在短時間內攻落七尾城。
由於畠山駿河守等人並沒有任何水軍眾的支援，故而無法對能登島進行攻擊，越後上杉家也因此能透過海路將軍糧源源不斷的送入七尾城中。
缺少水軍支援以及沒有大型攻城器械的畠山駿河守等人只能望城興嘆，並且逐步佔據先前匠作畠山家家臣們放棄的城池兵砦，打算以此來對七尾城進行長期的圍困。
在此期間，畠山駿河守等人接連奪取了多茂城、荒山城、青谷城、金丸城、館城、福次城、小丸山城等眾多位於鹿島郡、羽咋郡的城池兵砦。
不僅如此，畠山駿河守還打算切斷能登與越中方面的聯絡，迫使固守在七尾城內的匠作畠山軍出城來與自己進行決戰。
八條景定為了達到出其不意、攻其不備的目的，他直到行軍至守山城與柿崎景家等越中諸將合流之後才開始對外宣佈出陣能登救援匠作畠山家的訊息。
而此時的畠山駿河守等人仍然在圍困七尾城，在突然接到了越後上杉軍出陣的訊息後，完全出乎於他們的意料之外。
畠山駿河守等人自從舉兵攻入能登開始就完全沒有想過作為匠作畠山家盟友的越後上杉家會出兵救援，因為他們認為越後上杉家會先協助小笠原長時、村上義清等信濃諸將恢復舊領，故而對此完全沒有任何的防備。
畠山駿河守等人在勝山城緊急召開軍議後認為只有在鄰近越中邊境的荒山城和福水館兩地增派兵力佈防，同時加緊對七尾城的攻擊，必須要在越後上杉軍進入能登之前將七尾城攻落，如此一來越後上杉軍就只能撤兵返回了。
而畠山駿河守此刻也想不出更好的應對之策，也就只能派遣畠山九郎和畠山勝禪寺各率軍一千餘進駐福水館和荒山城兩地進行佈防，以此來阻遏上杉軍不斷西進的勢頭。
為了增加己方的勝算，畠山駿河守還致信加賀一向一揆眾，希望他們能夠繼續增派大量兵力進入能登協助自己。
杉浦玄任、超勝寺實顯、光德寺乘賢、下間壽法等加賀一向一揆首領們在接到畠山駿河守的書信之後也深知越後上杉家介入能登之後的後果是什麼，當即派遣下間賴清、下間賴俊等人率三萬餘加賀門徒眾進入能登，並且致信越中一向一揆眾的瑞泉寺證心、勝興寺顯榮等人，要求他們立即召集門徒眾出兵北上攻打北射水郡，打算以此來牽制即將進入能登的越後上杉軍。
加賀一向一揆眾為何會如此賣力的支援畠山駿河守等人，還是因為前任匠作畠山家家督畠山義總聯合神保長職、朝倉孝景攻打加賀協助小一揆一方。
儘管最終的結果是大一揆一方獲勝，並且於津幡一帶擊退了越中、能登等他國勢力的侵攻，但是小一揆一方的首領若松本泉寺等不少殘餘還是分別逃到了越前和能登兩國之中，得到了朝倉家和匠作畠山家的庇護。
眼下正值匠作畠山家內訌之際，加賀一向一揆眾怎麼能放棄這個絕佳的報仇機會呢？一旦他們助畠山駿河守奪取了能登四郡，那麼之前約定好的羽咋郡一郡之地就歸佛國管轄了，之後剩餘的三郡之地還能正大光明的進行佈教，何樂而不為呢？在進入九月後，秋雨更是連綿不絕，畠山駿河守一方的營地越來越潮溼泥濘。
畠山駿河守見麾下將士多有傷病，七尾城又一時難以攻克，便開始考慮退回加賀重整旗鼓之事。
但是在軍議上，能登一向一揆眾出身的吉田浦左衛門、小森大右衛門、伊勢八郎右衛門等人卻堅決不同意退兵，他們深知若是加賀一向一揆眾的大軍撤回了加賀，那麼孤立無援的能登一向一揆眾就必然會被匠作畠山家集中兵力迅速攻滅而身首異處，便向畠山駿河守諫言道：“鄰近諸國，窺此舉一歲矣。
今義續已困，奈何舍之去！”
畠山駿河守在沉思片刻之後，亦認為眼下還不可倉促退兵返回加賀，於是便與諸將再次商議破敵之策。
然而，就在畠山駿河守還在召開軍議的同時，擔任上杉軍先陣的內山滿久率控鶴軍下轄的五百名騎馬武士在福水館城外點燃周邊的民居村落。
固守在福水館的畠山九郎與前來支援的下間賴俊在商議過後決定趁著上杉軍眼下來援的軍勢寡少，一舉將這一部上杉軍殲滅，以此來震懾越後上杉家，使其不敢繼續支援匠作畠山家。
隨即，畠山九郎就與下間賴俊率一萬一千餘軍勢從福水館傾巢而出，內山滿久見狀當即率五百名騎馬武士全部後撤，將一向一揆眾全部吸引至清水原。
畠山九郎和下間賴盛仍然窮追不捨，一路尾隨上杉軍至清水原。
但是他們此刻卻並沒有料到為何自己所率的以步卒、門徒眾組成的一萬一千餘軍勢能追上全部以騎馬武士組成的上杉軍先陣。
就在這時，早就埋伏在三尾、見砂兩地的上杉軍趁機向散亂無序的一向一揆軍發起突襲了，內山滿久也率軍返回突入一向一揆眾陣中。
畠山九郎和下間賴俊二人皆是驚懼不已，完全沒有任何機會來收攏軍勢迎擊正在三面襲來的大量上杉軍。
加上漫山遍野之上全是上杉軍的竹雀紋旗，這就讓一向一揆軍認為上杉軍還有大量軍勢埋伏在那裡。
前來支援畠山九郎所部的加賀一向一揆軍賬面上雖然有著一萬餘人的大軍，但是其成分卻大都是拖家帶口的老弱婦孺，青壯甚少。
而畠山九郎部的軍勢也同樣如此，他們在遭遇上杉軍的突然襲擊後，上下皆是驚慌失措，進退失據，亂成一團，完全無法指揮。
戰至傍晚時分，畠山九郎和下間賴俊所部徹底崩潰，被上杉軍討取多達六千餘人，伏屍二十餘里，就連加賀一向一揆眾中的大將之一下間賴俊也被內山滿久所討取。
畠山九郎更是狼奔豖突，率十餘人逃回了福水館。
而內山滿久則是並沒有就此停下，一路追擊，直至福水館城下。
隨後，景定率柿崎景家、安田景元、神保長職、神保氏張等越中諸將也都紛紛抵達福水館城外，並且不斷用火矢射往城內。
這時的畠山九郎已經完全喪失了繼續抵抗上杉軍的能力，加上福水館城內的僅剩下不足百人，畠山九郎隨即驚懼逃遁，立即率殘部棄福水館而走，往勝山城方向逃亡。
上杉軍在順利奪取福水館後，景定可不想給加賀一向一揆軍有任何的時間反應過來，僅留下菅名重國率五百軍勢留守在福水館確保己方的後路和糧道，之後就率大軍迅速攻入能登腹地。
僅僅一天一夜的功夫，上杉軍就順利攻落先前被加賀一向一揆軍所奪取的金丸城、德丸城、館城等眾多城池兵砦，並且主力正朝著加賀一向一揆軍本陣所在地勝山城迅速進軍。
在聞知上杉軍攻入能登後接連攻落金丸城、德丸城、館城等眾多城池兵砦，先陣內山滿久已率四百五十餘名騎馬武士至井田原，上杉軍的總大將八條景定也已率大軍進駐德丸城，畠山駿河守在慌亂之下完全不知該如何是好，匆忙召集城內眾人商議應對之策。
勝山城內的加賀一向一揆眾諸將在聽聞上杉軍一戰擊潰畠山九郎和下間賴俊所率的一萬一千餘大軍後皆是惶惶不可終日，有的說堅守勝山城等待加賀方面援軍的，也有的說立即棄守勝山城退回加賀的，眾議紛紛，莫衷一是。
就在這時，匠作畠山家庶流出身的一門重臣畠山義遠、畠山將監等人在聽聞上杉軍已經擊潰加賀一向一揆軍並攻入能登後士氣大振，也紛紛在收攏敗軍之後趕至德丸城與上杉軍進行合流。
固守在能登島向田城、野崎城等地的能登守護代遊佐秀賴也趁此機會率五百餘軍勢趁著深夜於石崎港登陸，突襲並奪回了小丸山城，還討取能登一向一揆眾的有力武將小森大右衛門以下兩百餘人，與七尾城遙相呼應，互為犄角之勢。