儘管負責攻打九鬼領的山崎兵部少輔、家城主水佐、安保大藏少輔、橘宗忠等人放跑了最為重要的九鬼嘉隆、九鬼澄隆等人，但戰果還是頗豐的，北畠具教也並沒有因此對他們進行任何責罰，因為他預期的目的大都已經達成了。
北畠家、橘家、千賀家三家瓜分了九鬼領，並且北畠家成功在志摩一國中擴大了影響力，志摩國的國人領主們也都向北畠家獻上了人質。
可以說，只有九鬼家是最受傷的那一個。
而另一方面，隨著三河三寺之一的上宮寺被上杉軍攻落，就使得本證寺、勝曼寺更加孤立，就連三河一向一揆發起者之一的本證寺空誓都不得不為了自己和剩餘門徒眾的將來而考慮一條生路。
就在八條房繁、裡見義弘、石川定光、本莊繁長、真田幸隆等將所率的兩萬七千餘軍勢即將兵臨本證寺外之際，困守在本證寺中的本證寺空誓就主動派遣親信僧侶前往上杉軍中，向上杉軍提出了停戰議和的要求。
作為上杉軍大將之一的八條房繁就秉承一個宗旨——放棄抵抗，退出寺院。
本證寺空誓對於八條房繁這樣的回覆不禁陷入了沉思之中。
因為一向宗在三河紮根了很久，眼看就要像曾經的加賀那樣成為‘佛國’，若是就此放棄抵抗並退出寺院的話，自己和門徒眾又能去哪裡安身呢？尤其是本證寺還是三河三寺之首，是整個三河一向宗信徒心中的‘聖地’，若是被上杉軍搗毀的話，以後就沒有機會捲土重來了。
本證寺空誓也清楚加賀一向一揆眾的實力，上杉家先前甚至沒使出全力就將加賀三郡奪取，僅讓加賀一向一揆眾保留南加賀的江沼郡一郡之地苟延殘喘。
對於三河一向一揆眾的實力，本證寺空誓如今可是有著非常深刻的瞭解，根本不及上杉軍戰力的一半，甚至還不如岡崎松平軍、今川軍。
加上三河一向一揆眾與加賀一向一揆眾不同，並沒有配備新銳武器鐵炮，這就讓一向一揆眾在發起突擊時經常遭到上杉軍所配備的大量鐵炮火力壓制。
八條房繁見本證寺空誓遲遲沒有答覆，就讓隨大軍一同出陣的本誓寺超賢作為使者，出使本證寺。
同時，本證寺外的上杉軍各部則是做好了攻擊的準備，鐵炮隊全都點燃了引線，就待八條房繁一聲令下了。
結果，本誓寺超賢進入本證寺還不到一個時辰，本證寺空誓就被說服了。
畢竟本證寺空誓和本誓寺超賢一樣，都是出自一向宗總本山石山本願寺的一門眾，他們有著同樣的血脈，同樣的信仰，交流起來也容易的多。
本誓寺超賢向本證寺空誓做出保證，本證寺內的所有僧兵、門徒眾只要是願意離開的三河的，上杉軍不會做出任何阻攔，上杉軍還會為他們提供船隻。
當然，願意離開三河的一向一揆眾就只能前往伊勢長島，去依附那裡的一向宗寺院願證寺，不準進入遠江、駿河、志摩等地。
本證寺空誓如今也沒別的可以選，要麼和上宮寺勝佑、本宗寺實證等人那樣兵敗自焚；要麼像‘加州大將’七里賴周那樣直接出仕上杉家；要麼就選擇上杉軍大將八條房繁所安排好的——放棄抵抗，撤離寺院。
最後，本證寺空誓在思慮一番後選擇了撤離寺院，率殘餘的僧兵、門徒眾前往伊勢長島，去依附願證寺，之後再讓總本山石山本願寺來安置自己和三河一向一揆眾。
因為本證寺空誓知道在上杉軍佔有絕對優勢的情況下，自己做什麼都是徒勞無功的。
再加上伊勢一向一揆眾派來支援自己的伊勢水軍眾也被上杉家旗下水軍眾殲滅，不僅沒能打破上杉軍在海面上的封鎖，連一粒米都沒能送到本證寺來。
永祿三年，四月一日。
本證寺空誓正式向上杉軍開城投降，放棄本證寺，並率願意前往伊勢長島願證寺的五千餘人，在上杉軍的監視下乘船離開了三河，前往伊勢灣。
至此，三河一向一揆眾僅剩下勝曼寺一座寺院還在負隅頑抗著。
於是，作為上杉軍大將之一的村上義清就下令各部在勝曼寺周邊立起鹿角、拒馬與柵欄，綿延不絕，甚至還在勝曼寺外挖掘蚰蜒壕，打算以此來嚴密隔絕勝曼寺與外界的一切聯絡，徹底困死勝曼寺中的一向一揆眾。
然而，此時的勝曼寺中已經開始軍心動盪起來。
因為，原本勝曼寺中的存糧就不多，再加上勝曼寺周邊的城池兵砦全被上杉軍所攻落，導致勝曼寺不僅陷入了孤立無援的境地，甚至糧草也即將告罄。
而此時的勝曼寺了意還並不知曉本證寺空誓已經開城投降率殘餘一向一揆眾渡海前往伊勢長島的願證寺，還以為本證寺空誓還在和自己一樣，正在拼死抵抗。
四月五日，勝曼寺了意決定主動出擊，以求打破上杉軍那如同鐵壁一般的層層封鎖，便出兵攻打上杉軍位於勝曼寺西部的兵砦。
可是一向一揆眾卻被駐守在此地的真田幸隆所擊退，被討取者更是達到了兩千餘人，勝曼寺中的一向一揆眾軍心更為動搖。
為了不與勝曼寺了意一同殉葬，原岡崎松平家家臣加藤教明、江原忠盛（小笠原廣重女婿）、森刑部少輔（東三河十七騎眾）等人趁著勝曼寺了意在佛殿裡祈福誦經之際，突然衝入佛殿，將毫無防備的勝曼寺了意以及寺中諸多坊官討取。
之後，加藤教明、江原忠盛、森刑部少輔等人就趕緊將勝曼寺了意等人的首級送往上杉軍陣中，併為上杉軍開啟了勝曼寺的大門。
村上義清在令先前投效的本多正信、本多正重、渡邊守綱、松平康忠等人仔細辨別，在確認無誤後才下令對勝曼寺進行總攻。
勝曼寺了意被原岡崎松平家的家臣們暗殺後，就導致勝曼寺中群龍無首。
一向一揆眾在面對上杉軍從四面八方發起的攻擊時手足無措，根本不知道該如何應對。
在加藤教明、江原忠盛、森刑部少輔等人裡應外合之下，勝曼寺很快就被上杉軍攻落，寺中僅剩的五千餘一向一揆眾皆被上杉軍所討取，就連老弱婦孺都沒有放過。
至此，三河一向一揆堅持了還不到一年就被上杉軍以絕對優勢的兵力討平，三河一國裡的一向宗寺院也盡數被破卻，殘餘的一向一揆眾也隨本證寺空誓逃往伊勢長島的願證寺。
三河一國宣告靜謐，從此成為上杉家的領國。