還沒等佐久間信盛在緒川城裡將馬紮坐熱，服部友貞、佐治信方等人在第二次三河灣海戰中慘敗的訊息很快就傳入了城中。
佐久間信盛自然不敢將此事進行隱瞞，直接留下其子佐久間信榮、族侄奧山勝昭、重臣進藤堅盛等人守備緒川城、橫根城、龜崎城等鄰近尾張、三河兩國境目地帶的城池兵砦，直接則是親自動身前往岐阜城，向主君織田信長請罪。
當織田信長得知海、陸兩方面敗報後感到心痛無比：這佐久間信盛、佐治信方等人還真是中看不中用啊！虧自己曾經還對他們委以重任，結果關鍵時候掉鏈子，使得織田家眼下極為被動，原先的作戰計劃也全都化為泡影了。
在萬般無奈之下，織田信長只好大膽啟用足輕眾出身的木下藤吉郎，並以木下藤吉郎為大高城城主，領其率川並眾的蜂須賀正勝（蜂須賀小六）、前野長康、松原內匠、坪內利定、三輪吉高、梶田直繁等將進駐大高城，沿途召集東尾張諸郡各路散兵，準備抵禦上杉軍侵攻尾張。
然而，木下藤吉郎在進駐大高城後半個月，才只召集了兩千餘軍勢。
而此時的裡見義弘已經兵分三路，派遣正木信茂率一千五百餘軍勢負責攻打橫根城、大府城；派遣土岐為賴、裡見民部大輔率三千五百餘軍勢負責攻打龜崎城、乙川城。
至於裡見義弘本人，則是親率本隊六千餘軍勢佯攻沓掛城，並做好隨時支援正木信茂、土岐為賴、裡見民部大輔等人的準備。
等到佐久間信盛主動前往岐阜城請罪後，織田信長給予了這位織田家宿將很大的寬容。
當然，一開始他還是大怒了一場，當場削去佐久間信盛的家老、知多郡郡代、愛知郡郡代等職，甚至還將其關入了岐阜城的地牢之中。
但沒過兩天，織田信長就在明智光秀的建議下放了佐久間信盛，並安慰他道：“我已瞭解了叄州戰事的經過，知道此次敗北並非你之過，都是又六郎、下間豐前法橋等人不聽號令、擅自出戰所導致的.”
這就等於，織田信長在間接承認了自己用人不當、任人唯親的過失。
畢竟眼下正值織田家用人之際，織田信長自然不能對佐久間信盛進行棄而不用，之後就令他盡全力協助木下藤吉郎抵禦上杉軍的侵攻，並在之後的戰事中戴罪立功。
由於佐久間信盛尚未返回知多郡、愛知郡的領地，裡見義弘就趁機對三河、尾張兩國境目地帶的城池兵砦進行掃蕩，如入無人之境。
接連攻落了畔田城、成巖城、長尾城、龜崎城、大府城、諸輪城等地，甚至上杉軍還一度兵臨佐久間信盛的居城緒川城下，並在城下町中濫妨狼藉一番後才揚長而去。
期間，織田信長馬廻眾出身的魚住隼人因畏懼上杉軍的兵鋒，甚至棄藤島城而逃，結果被木下藤吉郎所部武士擒獲後送往岐阜城，被織田信長下令斬首示眾。
面對己方頹勢已顯，織田信長只好帶著足利嗣知，親率兩萬餘軍勢坐鎮在南近江的觀音寺城，意圖以此來震懾一番上杉將軍家，企圖讓上杉將軍家延緩對織田家的用兵。
隨著佐久間信盛返回本領，以及木下藤吉郎率兩千餘軍勢前來馳援後，裡見義弘急忙解除了對緒川城、阿久比城、沓掛城等地的襲擾和佯攻，在燒燬了一部分無法帶走的糧草輜重後，就退回了三河。
不過，織田軍此番只是收復位於尾張、三河兩國境目地帶的失地，並沒有進而攻入三河的打算。
因為他們已經領教過裡見勢的真正實力，也深知伊勢一國的一向一揆眾不可靠，根本不能指望這些‘見小敵勇，見大敵怯’的一向一揆眾來牽制上杉軍。
相反，上杉將軍家在獲得第二次三河灣海戰的勝利後，一舉扭轉了原先在東海道諸國不利的局勢。
甚至還讓織田家旗下的水軍眾被嚴密地封鎖在各個港口內，不能達到襲擾上杉將軍家海上航線的目的，更無法挑戰上杉將軍家的海上霸權。
可以毫不誇張地說，在第二次三河灣海戰奠定的戰略地圖上，讓上杉將軍家最終在數年之後擊敗織田家，徹底靜謐本州島中部地區。
另一方面，八條景定為了進一步分化反上杉將軍家一方的實力，就在竹中重治的建議下，派遣忍者分別潛入越前、若狹兩國，主動挑起朝倉景健、朝倉景鏡、朝倉景綱、魚住景固、前波吉繼（桂田長俊）、富田長繁（富田長秀）等朝倉家叛臣的內訌。
同時，景定也開始著手對被圍困在坂本、堅田兩地的一向一揆軍發起最後的攻擊。
可是，令景定沒有想到的是，慄津右近、松尾左近等石山本願寺代官是色厲內荏，上杉軍還沒兵臨砦下，他們就率先乘著小船經琵琶湖逃離了坂本，意圖逃往越前一國去投奔信奉一向宗的阿波賀三郎。
主將臨陣脫逃這樣的事情，對於一支大軍的消極影響是層層擴大的。
首先是江北十寺的坊官，只要是雙腿沒傷沒病的，紛紛爭先恐後的奪取船隻，意圖逃往淺井領。
緊接著，江北十寺所組織的四萬餘一向一揆軍徹底崩潰，僅相互之間踩踏而亡的就數以萬計。
景定在得知此事後，當即下令麾下各部軍勢向一向一揆軍發起猛攻。
其中，本莊繁長的表現最為活躍，他率右龍騎軍左右突圍，出入如飛，勢不可擋。
一向一揆軍則是亂作一團，四處逃竄。
上杉軍很快就將一向一揆軍所控制的坂本、堅田兩砦攻落，並一路追擊一向一揆軍潰軍至琵琶湖岸邊。
剩餘的一向一揆軍走投無路，因為沒有了多餘的船隻，他們為了求得一線生機，只好逃入琵琶湖中，但在琵琶湖中溺亡的數不勝數。
自坂本、堅田兩地至琵琶湖岸邊，伏屍數里，一向一揆軍被討取的多達兩萬餘級。
而他們先前搶掠比叡山延歷寺的錢糧最終絕大部分沒能順利帶走，反而都被上杉軍奪取了。