八條景定之所以在越前、加賀兩國靜謐後不久就對南攝津大規模用兵，並非是他好大喜功，而是因為石山御坊是一向宗的總本山，若不將之平定，上杉將軍家在近畿諸國將永無寧日。
當然，景定還不忘向本願寺顯如提出和談條件誓書以及起請文：一、赦免石山御坊之中所有人等；二、為謹慎起見，雙方應派遣人質；三、播州英賀御坊在石山御坊開城後停止與當家為敵的舉動；四、由博陸公、上杉黃門侍郎、今川黃門侍郎等人率軍接管寺內町，之後並進駐御影堂、阿彌陀堂；五、石山御坊開城以後，當家將於洛陽龍谷山一帶新建西本願寺，以供前法主本願寺顯如、如春尼等人入駐，三男本願寺準如為住持；六、前法主本願寺顯如長男本願寺教如許可於洛陽烏丸七條一帶分立東本願寺，並擔任東本願寺住持。
七、石山御坊寺內町町眾仍能繼續居住在寺內町之中。
對於景定所提出的和談條件，本願寺顯如、如春尼、本願寺教如、本願寺準如、下間三家老（下間賴廉、下間仲之、下間賴龍）等人在經過短暫商議後一致同意，因為石山本願寺眼下已經是到了戰既不能戰，守又守不久，完全陷入了困境，根本沒有更好的選擇。
不僅如此，正親町天皇的長子誠仁親王也受景定、上杉氏虎二人所託，致信本願寺顯如：“在八條內府、上杉亞相的奔走斡旋之下，將成為佛法繁榮之基礎。
若貴寺退出石山御坊，則萬事合宜。
此事也是天子之意，具體事由將由近衛執柄（關白唐名之一）、庭田亞相、勸休寺黃門侍郎等人告知。
惶恐惶恐.”
隨著朝廷方面的再度介入，石山本願寺高層迫於形勢，只能同意石山御坊開城。
因為，本願寺顯如的死就等於親鸞以來的血脈斷絕，同時也是一向宗法脈的斷絕。
為了保全法脈的存續，以及重視朝廷權威，本願寺顯如不得不接受世俗權力的支配。
為了體現石山本願寺一方的誠意，本願寺顯如很快就命親族、坊官等盡數退出御影堂、阿彌陀堂，並在下令剩餘守軍全面禁止抵抗、放下武器後，就與如春尼、本願寺教如、本願寺準如、下間三家老（下間賴廉、下間仲之、下間賴龍）等人一同退出了石山御坊，在上杉軍的護送下前往京都。
同時，本願寺顯如還不忘派遣使者前往播磨各地，號召一向宗信徒停止與上杉將軍家對抗。
然而，統轄著‘播磨六坊’的本德寺住持本德寺教什（本願寺顯如妹夫）卻公然違背本願寺顯如的‘法旨’，反而號召播磨一國的一向宗信徒繼續襲擾備前、攝津、丹波的境目地帶，拒不接受與上杉將軍家停戰議和一事。
為此，本願寺顯如不得不致信本德寺教什的正室、自己的妹妹顯妙，要求她儘快說服本德寺教什，不要做無謂抵抗，儘快降服於上杉將軍家軍門之下才能獲得寺院存續。
但是，本德寺教什並沒有理會本願寺顯如的一片苦心，反而繼續在本德寺中囤積糧草，做好籠城固守的準備。
另一方面，景定也沒有為難已經降服的本願寺顯如等石山本願寺高層，反而以上杉將軍家的名義賜予他們每人一百兩黃金。
對於拒不降服的本德寺教什，景定則是令時任一向宗法主的本誓寺超賢對本德寺進行破門處理。
至此，石山本願寺正式降服於上杉將軍家的軍門之下，同時也為長達三年的石山御坊之戰畫上了休止符。
隨著越前、加賀、攝津等國戰事的結束，上杉將軍家已經消除了腹心之患，在近畿諸國的正統地位也基本穩固，攻略播磨一國的時機已逐漸成熟。
於是，景定就先令山城一國的奉行眾河隅忠清、飯田長家等人前往南攝津，對石山本願寺的寺領進行大規模檢地，而後讓上杉氏虎擔任總大將，上杉景信擔任副將，今川氏定擔任軍奉行，直江景綱擔任軍糧奉行，赤井直正與波多野秀治二人擔任先導役，節制四條虎定、小島貞興、三好康長、有馬豐氏、池田直正、和田惟長、安宅清康、宇喜多直家、等將，由他們率攝津、丹波、淡路、讃岐、阿波、和泉、河內等國之兵，水陸並進，準備大規模侵攻播磨一國。
之所以景定安排四條虎定出兵播磨，就是因為想給他一個立功的機會，順便解除他的蟄居。
畢竟鹽飽水軍眾、讃岐水軍眾還歸四條虎定統轄，而之後的播磨征伐需要的就是這些水軍眾封鎖沿海，斷絕播磨一向宗信徒以及播磨諸將與外界的聯絡，使其無法獲得來自他國一向宗信徒的支援。
在上杉氏虎離開京都之前，景定還不忘告誡他一番：“今天下本州大定，近畿諸州奠安，惟播州未平耳。
餘以赤松、小寺、別所等諸將嘗遣使修好，存事大之禮，故不忍加兵，遣使數加開諭，冀其覺悟。
但播州諸將惑於本德寺教什之言，反以兵犯境，雖敗衄而去，然豺狼之心終懷齧噬，不可不討。
今命汝率水陸之師，分道並進，首尾攻之，使彼疲於奔命，勢當必克。
但師行之際，在肅士伍、嚴紀律以懷降附，無肆殺掠，昔武田大膳大夫之事，可以為戒，汝等慎之.”
雖說上杉將軍家此刻佔有絕對的優勢，但景定仍然要舉出武田信玄這個反面教材。
若不是武田信玄在信濃攻略中多次屠城，北信濃諸將也就不會死心塌地的追隨上杉家一方。
與此同時，稱雄於北九州諸國的大友宗麟也開始蠢蠢欲動。
得益於與基督教會關係良好的原因，大友家不僅獲得了來自西洋的糖果、傢俱，甚至還獲得了一批價格低廉的佛郎機炮，大友宗麟還將其稱之為‘國崩’。
這時的大友宗麟已經隱居，將家督之位傳給了長子大友義統，但並不代表他就此不理政務。
為了進一步穩固大友家在筑前的統治，大友宗麟就安排親信重臣戶次道雪入駐立花山城，並繼承立花家家名，擔任筑前守護，提防原田鑑尚、麻布元重、宗像氏貞等國人領主再度叛離大友家。